ケモインフォマティクス

実験計画法・適応的実験計画法における特徴量選択とモデルの適用範囲

分子設計・材料設計・プロセス設計において、最初の実験・シミュレーションの合成条件・製造条件・プロセス条件などを実験計画法により決め、実験やシミュレーションをしたあとに得られるデータを用いて、特徴量 x と材料の物性・活性・特性 y との間で...

ホモポリマーとコポリマーを同時に設計する高分子設計手法を開発しました![金子研論文]

金子研の論文が Polymer Engineering & Science に掲載されましたので、ご紹介します。タイトルは Molecular design of monomers by considering the dielectric...

GridSearchCVでハイパーパラメータの最適化に失敗した時の原因と対処法

回帰モデルやクラス分類モデルにおけるハイパーパラメータを最適化するため、scikit-learn の GridSearchCV を使用する人がいらっしゃると思います。特に複数の種類のハイパーパラメータがあるとき、GridSearchCV を...

GTM や GTM Regression (GTMR) のハイパーパラメータの高速最適化

DCEKit に搭載されている Generative Topographic Mapping (GTM) や Generative Topographic Mapping Regression (GTMR) について、 クロスバリデーション...

実験計画法における特徴量の標準化(オートスケーリング)

材料設計・プロセス設計において、合成条件・製造条件やプロセス条件などの特徴量 x と物性・活性・特性などの目的変数 y の間で数理モデル y = f(x) を構築し、構築したモデルを用いて y が目標値となるような x の値を探索します。モ...

線形手法を使うべきか、非線形手法を使うべきか

分子設計・材料設計・プロセス設計・プロセス管理において、分子記述子や合成条件・製造条件・プロセス条件やプロセス変数などの特徴量 x と物性・活性・特性などの目的変数 y との間で数理モデル y = f(x) を構築したり、モデルに x の値...

回帰分析手法やクラス分類手法のハイパーパラメータをベイズ最適化で高速に最適化する

DCEKit に搭載されている Gaussian Mixture Regression (GMR) や Variational Bayesian Gaussian Mixture Regression (VBGMR) について、 クロスバリ...

特徴量(変数)が多いときもベイズ最適化でOK?分子記述子のときも?

分子設計・材料設計・プロセス設計において、ベイズ最適化により分子の化学構造や、材料の合成条件・製造条件や、プロセス条件などを最適化します。 ガウス過程回帰により、分子記述子・合成条件・製造条件・プロセス条件などの特徴量 x と分子や材料の物...

化学構造・分子構造を対象にしたデータ解析・機械学習をするときの二次元構造や三次元構造の考え方

ケモインフォマティクス・マテリアルズインフォマティクス・プロセスインフォマティックスの中で、化学構造・分子構造を対象にしてデータ解析や機械学習を実施することもあります。化合物の化学構造から分子記述子を計算したり、記述子 x と物性・活性・特...

予測誤差は全部ノイズ!~ノイズを0にする方向で考えよう!~

分子設計・材料設計・プロセス設計・プロセス管理において、分子記述子や合成条件・製造条件・プロセス条件などの説明変数 x と物性・活性・特性などの目的変数 y の間で数理モデル y = f(x) を構築し、構築されたモデルを用いて x の値か...
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