ケモインフォマティクス

講演会やセミナーなどでよくいただく質問の一つに、データの可視化手法・見える化する手法はどのように選べばよいですか、というのがあります。難しい質問です。というのも、回帰分析やクラス分類であればこちらの基本的な解析の流れにそって適切な手法を選ぶ...

データ解析・機械学習が得意な方が、扱うデータセットにおける実験系の実験科学者と共同で研究やプロジェクトを進めたり、実験科学者がデータ解析・機械学習を勉強してデータサイエンティストになったりすることがあります。このような場合のメリットについて...

一般的なデータ解析・機械学習では、一つのデータセットがあるとき、一つのモデルを構築します。こちらのデータ解析の流れにそって、最終的に、例えばガウス過程回帰で、一つのモデルを構築することになります。アンサンブル学習では、たくさんのサブデータセ...

金子研の論文が Analytical Science Advances に掲載されましたので、ご紹介します。タイトルはPrediction of spin–spin coupling constants with machine learn...

実験計画法のお話です。こちらの記事では、わかりやすさのために () 付きで「直交表」としていますが、厳密に言えば、いわゆる古くから使われている直交表ではありません。直交表のようではありますが、それとは別の方法で最初の実験条件の候補を選んでい...

説明変数 X と目的変数 Y との間でモデル Y = f(X) を構築するとき、特に Y が連続値の場合は回帰分析が行われます。回帰分析手法にはいろいろありますが、ここではガウス過程回帰 (Gaussian Process Regressi...

機械学習の手法の中には、カーネル関数を用いた手法があります。サポートベクターマシン、サポートベクター回帰、ガウス過程回帰あたりが有名と思います。他にもリッジ回帰や主成分分析、独立成分分析など、いろいろな手法とカーネル関数を組み合わせることが...

データセットの中に欠損値があるときは、iGMR が有効であることはこちらに書きました。たとえば、論文や特許からデータを取得したときなど、他のデータ (研究室内や社内のデータなど) と合わせようとしたときに、論文や特許ではいくつかの実験条件が...

DCEKit への新機能追加です。こちらの Iterative Optimization Technology (IOT) を実装しました。IOT では、純成分のスペクトルと混合物のスペクトルのみから、混合物における各純成分の濃度 (モル分...

DCEKit に今回追加したのは Variational Bayesian Gaussian Mixture Regression (VBGMR) と、GMR や VBGMR におけるクロスバリデーションによるハイパーパラメータ最適化です。...